使馆卫队”进入北京，清政fǔ先是拒绝，后被迫于31日同意，但提出“每馆以二三十人为率”结果列强先后派出400多人进京，大大超出了清政fǔ的限制。后来列强又派遣西摩尔带领2000人前往北京，这些行为对清政fǔ形成了严重威胁。

对此，清政fǔ一面继续发布镇压义和团的命令以消除列强派兵的理由，一面又调集军队进入北京以防不测。对外国人抱有敌意的董福祥所率领的武卫后军（甘军）即在6月9日被调入北京驻守，6月11日，日本书记官杉山彬前去迎接入京的西摩尔联军，在永定门外被甘军所杀。事后，大臣荣禄亲赴日本使馆道歉。

列强向北京强行进军和义和团抵御外**队，使清廷对义和团的态度开始出现转变。面对列强咄咄逼人的态势，清廷内部主和与主战，主剿与主抚的分歧更加严重。清政fǔ于6月5日派赵舒翘和何乃莹，6月6日派刚毅去涿州“劝散”义和团，实为考察情况。结果刚毅的态度是“力言拳民可恃”赵舒翘等也赞成采取招抚的措施。

再加之载漪等官僚的鼓动，清政fǔ逐渐开始承认义和团为合法组织，这种态度直接导致6月初义和团大量进入北京。从6月10日起，在清朝官员的默许下，义和团开始大量进入北京。在初期，义和团与北京的外国人关系紧张，但并未发生大规模流血事件。6月12日“今晨探报，东华门外教堂起火，不少教民牵而北去。是为义和团入京第一次肇祸也”有论者认为这起事件很可能与克林德擅自拘捕路过使馆区的义和团员有关，北京的局势迅速恶化。

在使馆卫队入京后，以德国公使克林德为首的部分外国外交人员一味使用武力解决问题。6月14日，克林德带领水手一排行于内城之上，发现有沙地有义和团练习，即毫不迟疑发令开枪，当场打死二十余人。此后使馆卫队开展了“猎取拳民行动”多次主动攻击义和团员，这种行为反而使得局面更加失控，愤怒的义和团在北京到处焚烧教堂和攻杀教民。

主和派官员袁昶指责克林德说：“门吏等方与步军统领议弹压京城内外，遵旨严拿首要，以靖地方而弭邻衅。不意德克使闇于事机，擅自拿办拳匪，以致jī变”而克林德本人则在6月20日去总理衙门交涉时与神机营章京恩海相遇，并被后者射杀，酿成著名的“克林德事件”

6月10日，列强不顾清政fǔ的阻拦，正式组建八国联军，由级别最高的英**官西摩尔为统帅，美**官麦卡加拉为副统帅，率军自天津向北京进发，但由于沿途铁路许多已被义和团拆毁，再加之义和团与甘军的不断进攻，西摩尔在杨村陷入困境，被迫后撤，又在归途中遭到义和团与聂士成部的攻击，最终于6月26日败回天津租界。西摩尔提到此次战斗时说“义和团所用设为西式枪炮，则所率联军必全军覆没”史称为“廊坊大捷”

在廊坊义和团与西摩尔交战同时，列强继续集结兵力。八国以日本派遣的军队人数最多，派遣士兵约23000人，军舰约20艘。不过登岸的日军只有八千人，俄军四千八百人，英军三千人，美军二千一百人，法军八百人，意军五十三人，奥军五十人。

八国联军于6月16日向大沽口炮台中国守军下达最后通牒，要求交出炮台，遭拒绝。次日，距通牒限定的时间还差70分钟，列强的军舰即与守军交火，守军力战不敌，大沽口失陷，守将喀什噶尔提督罗荣光牺牲。